Es un conjunto de enfermedades independientes, enfermedad de Crohn, colitis ulcerosa y colitis indeterminada que provocan procesos inflamatorios crónicos en diferentes partes del tracto gastrointestinal (van desde la boca al ano). Las zonas más afectadas son el íleon terminal y el ciego, aunque puede afectar únicamente al recto.
La crónica de esta enfermedad cursa periodos de inactividad o quiescencia donde hay remisión de la enfermedad, con periodos de actividad clínica que se denominan brotes. La diferencia principal entre el EII y otros procesos inflamatorios intestinales es que en el caso de EII se desconoce su etiología.
Lo mas aceptado actualmente respecto a su etiología es la disregulación de la respuesta inmune del paciente frente a la flora bacteriana residente en su organismo.
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